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純化的RNA的點雜交和狹線雜交
發布時間： 2021-12-21 點擊次數： 1051次原理
點雜交和狹線雜交技術（Kafatos et al. 1979) 用于在同一固相支持物（通常為帶電荷的尼龍膜）上固定幾種核酸樣品，然后用合適的探針與已固定的樣品雜交，并由此判斷靶序列的濃度。通過估計樣品點發射出 的信號的強度，與已知濃度的標準品信號強度 進行比較，確定待測樣品中靶序列的量。
材料與儀器
RNA 檢測樣品、標準品和陰性對照 探針標記與變性
NaOH 預雜交液 RNA 變性液 SSC
印跡裝置 絞鏈儀 帶正電荷尼龍膜 厚印透紙 水浴鍋步驟
一、材料
1. 緩沖液與溶液
NaOH ( 10 mol/L)
預雜交液
RNA 變性液
0.1X SSC ( 含 0.1% SDS，m/V)
0.1X SSC ( 含 1%SDS，m/V)
0.5X SSC ( 含 0.1% SDS，m/V)
1X SSC ( 含 0.1% SDS，m/V)
2X SSC
20X SSC
2. 核酸與寡聚核甘酸
RNA 檢測樣品、標準品和陰性對照
3. 探針
探針標記與變性
4. 專用設備
印跡裝置
絞鏈儀（如 Stratalinker, Stratagene; GS Gene Linker, Bio-rad) 或真空爐、微波爐
帶正電荷尼龍膜
厚印透紙（如 Whatman 3 MM, Schleicher&Schuell GB004, 或 Sigma QuickDraw)
預熱水浴鍋到 68℃
二、方法
安裝印跡裝置
1. 切一張合適大小的帶正電荷尼龍膜。用鉛筆標上表示方向的記號。用水把膜簡單弄濕，在 20X SSC 中室溫泡 1 h。
2. 在膜浸泡期間，先用 0.1 mol/L NaOH 小心清洗印跡裝置，再用無菌水洗干凈。
3. 把兩片厚濾紙用 20X SSC 浸濕，再放到真空器頂部。
4. 把樣品槽插入裝置的上部，把濕尼龍膜放在樣品槽加樣孔的底部，用吸管在膜的表面滾動以去除膜與裝置夾層中的氣泡。
5. 加緊夾板，連接真空管。
6. 加入 10X SSC 直至液面沒過尼龍膜，關掉真空，再用 10X SSC 充滿。
RNA 樣品準備
7. 把每個 RNA 樣品（溶解在 10 μl 水）分別與 30 μl RNA 變性液混合。
8. 65℃ 溫育 5 min，然后在冰上冷卻。
9. 向每個樣品中加入等體積 20X SSC。
10. 輕輕向印跡裝置中吸入 10XSSC，直到淹沒尼龍膜。
RNA 樣品的印跡和 RNA 在膜上的固定
11. 把所有樣品輕輕加入狹線中，然后輕輕吸干膜。當所有樣品都鋪到膜上后，每個狹線用 1 ml 10XSSC 洗兩次。
12. 當第二次洗膜完成后，繼續輕輕吸干膜。
13. 取下膜，然后用紫外交聯、烘烤或微波照射把 RNA 固定在膜上。
固定化 RNA 的雜交與洗膜
14. 把膜放入烤盤或雜交爐中，加入 10~20 ml 預雜交液 68℃ 溫育 2 h。
15. 把已變性的放射性標記的探針直接加到預雜交液中。在適當的溫度下繼續溫育 12~16 h。
16. 雜交完后從塑料袋中取出膜，然后盡可能快地把膜轉移到室溫下裝有 100~200 mJ、1X SSC ( 0.1% SDS) 的塑料容器中。蓋緊塑料容器，放到搖床上輕搖 10 min。
17. 把膜轉移到另一個裝有 100~200 ml 的、預熱到 68℃ 的 0.5X SSC ( 含 0.1% SDS) 的塑料袋中，然后在此溫度下輕搖 10 min。
18. 按步驟 17 重復洗膜兩次，使總的洗膜次數達到三次。
19. 用濾紙吸干膜，在 -70℃ 條件下放射自顯影 24~48 h ( Kodak XAR-5 或相當的膠片)。鎢酸鹽型的增感屏比舊式稀土型的效果更好。當然，磷光成像儀也可以用來成像。以上就是本期的內容，更多資訊，歡迎關注安培生物科技有限公司了解更多技術與產品資訊。
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